Биологическая активность
5'-Фосфорамидит биотина служит полезным инструментом для включения биотина в олигонуклеотиды. Однако он имеет определенное ограничение: его можно добавлять только к 5'-концу олигонуклеотидной цепи. Защитная группа DMTr (диметокситритил) в положении N1 биотина играет решающую роль в процессе связывания. Он эффективно предотвращает образование разветвленных структур, обеспечивая более точный и контролируемый синтез меченных биотином олигонуклеотидов. Сам биотин обладает достаточной гидрофобностью. Это свойство позволяет относительно просто разделить олигомеры, меченные биотином (в состоянии выключенного DMT), и немеченые олигомеры. Тем не менее, группа DMTr по-прежнему имеет свою уникальную ценность. Его можно использовать для облегчения процесса очистки при использовании обращенно-фазовых картриджей и высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ). Эта дополнительная помощь со стороны группы DMTr может привести к более эффективной и точной очистке желаемых олигонуклеотидов, меченных биотином.
Оригинал на английском
5'- Biotin phosphoramidite serves as a useful tool for incorporating biotin into oligonucleotides. However, it has a specific limitation in that it can only be added to the 5'- end of the oligonucleotide chain. The DMTr (dimethoxytrityl) protecting group on the N1 position of biotin plays a crucial role during the coupling process. It effectively prevents the formation of branched structures, ensuring a more precise and controlled synthesis of the biotin - labeled oligonucleotides. Biotin itself possesses sufficient hydrophobicity. This property allows for a relatively straightforward separation between biotin - labeled oligomers (in the DMT OFF state) and unlabeled oligomers. Nevertheless, the DMTr group still has its unique value. It can be utilized to facilitate the purification process when using reverse - phase cartridges and high - performance liquid chromatography (HPLC). This additional assistance from the DMTr group can lead to more efficient and accurate purification of the desired biotin - labeled oligonucleotides.
Химические свойства
- CAS №
- 135137-87-0
- Брутто-формула
- C₄₆H₆₄N₅O₆PS
- Мол. масса
- 846.07 г/моль
- SMILES
- S1C[C@H]2[C@@H]([C@@H]1CCCCC(NCCCCCCOP(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N)=O)NC(N2C(C1C=CC=CC=1)(C1C=CC(=CC=1)OC)C1C=CC(=CC=1)OC)=O
- Синонимы
- BIOTIN AMIDITE; [1-N-(4,4’-Dimethoxytrityl)biotinyl-6-aminohexyl]-2-(cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite; 5'-BIOTIN PHOSPHORAMIDITE; 5′ Biotin Amidite; 5′-Biotin Phosphoramidite и ещё 5
3D-структура молекулы
Вращайте мышью · Колесо — масштаб
Хранение и физические свойства
- Условия хранения
- 2 года -20°C порошок, 2 недели 4°C в ДМСО, 6 мес. -80°C в ДМСО
Безопасность и документация
Только для научно-исследовательского применения. Не предназначено для использования у пациентов или в качестве лекарственного средства.