CITE-seq + V(D)J: одноклеточное профилирование Т-клеточных репертуаров в опухоли

Понимание Т-клеточных репертуаров в опухолевом микроокружении — ключ к разработке персонализированных терапий. Multi-omics single-cell платформы делают это рутинной задачей.

Что измеряется одновременно

• Транскриптом (RNA-seq): 18 000+ генов;
• Поверхностные белки через ADT-олигонуклеотиды: 100+ маркеров (CD3, CD4, CD8, PD-1, TIM-3, и т.д.);
• TCRαβ / IgH / IgK последовательности (V(D)J);
• Опционально: ATAC-seq, мутационный профиль.

Применения

• Идентификация опухоль-специфичных клонотипов TCR для TCR-T терапии;
• Картирование Т-клеточных функциональных состояний (стволовость → активация → истощение);
• Анализ ответа на чекпоинт-ингибиторы.

Что нужно

BD Rhapsody, 10x Chromium, Parse Biosciences. Реагенты — олиго-конъюгированные антитела (TotalSeq), CITE-seq панели — в нашем каталоге.